Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRBQ9Y5M8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms