Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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