Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms