Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms