Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms