Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUDCQ9Y266 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms