Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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