Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJD2Q9UKL4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms