Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms