Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC23A1Q9UHI7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms