Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms