Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms