Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COMMD8Q9NX08 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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