Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSDC1Q9NW68 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BSDC1Q9NW68 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms