Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO28Q9NVF7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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