Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L1Q9NU39 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms