Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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LHX9Q9NQ69 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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