Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms