Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1LQ9HCJ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms