Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms