Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX5Q9H2C1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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