Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms