Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH6AQ9H0K4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms