Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM4Q9C037 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM4Q9C037 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms