Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms