Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms