Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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