Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB1Q9BVT8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms