Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms