Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC22CQ9BRL7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms