Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3AQ99856 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3AQ99856 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms