Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms