Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORT1Q99523 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms