Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms