Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms