Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms