Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms