Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRAT1Q92837 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FRAT1Q92837 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms