Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms