Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D1Q8WV19 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms