Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER1Q8TDN7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER1Q8TDN7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms