Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGA8

OR4F17, Olfactory receptor 4F17, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR4F17Q8NGA8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OR4F17Q8NGA8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OR4F17Q8NGA8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms