Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms