Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC4Q8N9L1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms