Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMER3Q8N944 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMER3Q8N944 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms