Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF182Q8N6D2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms