Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC18Q8N456 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms