Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMTC2Q8N394 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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