Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL34Q8N239 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms