Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms